GWASはコホート・スタディがないと出来ません。そして、そこで必要なサンプル・サイズをNとすると、Nはできるだけ大きく、たくさんの個体数をもつほうが、一般には強く求められます。いわば数式でいえば、｢N=n (n>>1)｣となるのでしょう。 しかし、コホート・…

気象庁が24時間体制で監視している活火山が、我が国には４７つあります。箱根山はそのひとつ。大涌谷がその火口とは知りませんでした。 富士山の降灰被害も深刻になるとのシミュレーションもあり、実際に避難の仕方など考えておく必要がありそうです。

日本の１１０の活火山が過去2000年の間に1162回の噴火があったという報告が、宇都宮大学の中村洋一教授(火山学)のグループが調べだしたという記事が、朝日新聞21012年12月2日(日)の朝刊の1面に載っていました。 以前、高校の地理の時間で習ったような「休火…

「あくび」を最近よくします。「眠たい」から「あくび」をよくすると思っていました。しかし、「あくび」は眠りたい本能を揺り動かして眠らなくしようとする、脳のけなげな努力の結果出てくるものとは全く知りませんでした。確かに、眠たくとも寝れないとき…

東京ギャルの「カワイイ」が、「悪羅悪羅(オラオラ)系」ファッションに進化しているといいます。、「悪羅悪羅(オラオラ)系」とは、どうも、少し強がったり悪がったりする若い男女の新しいファッションということのようで、世界的に大爆発の可能性を秘めてい…

それでなくとも超大量な塩基配列データの産出で、研究現場が右往左往している現状の中で、数年後には洪水のような臨床仕様の塩基配列データが溢れてきます。まさに、「ビッグデータ」の大きな課題が現実化してきます。 倫理問題も重要ですが、それも含めてあ…

体細胞のゲノム情報が、細胞ごとに予想以上の変異があることが分かってきました。さらに1個人が約６０兆個の細胞を持っていますから、その細胞は知らないうちに、皮膚細胞・髪の毛・涙など、そこらじゅうにあることになります。 また、一卵性双生児の生殖細…

いよいよ、塩基配列データのもつ意味合いが、大きく２つにわかれることが明確になってきました。 「検査(アッセイ系)結果」としての塩基配列データと「保存記録(アーカイブ)」としての塩基配列データです。前者はいわば結果が分かれば「使い捨て」の塩基配列…

ライフテクノロジー社の日本法人は、次世代シーケンサーの最新機種「イオン・プロトン」を病院向けに販売すると、最近は発表しました。 がん患者の診断や治療に使えるということで、来年の2013年の後半にも製造･販売承認を厚労省に申請して、3年後にも販売を…

昨日から2日間に渡って、東大の赤門横の伊藤国際センターで、東大薬学の入村達郎教授の業績をたたえる国際シンポジウムがおこなわれました。 「Glyco-minded Biology as a Base of Pharmcological Sciences」といった題目でした。「Glyco-minded」という言い…

昨日、第５回DNA鑑定学会大会が成功裏に終了いたしました。 ご協力・ご支援をいただいたすべての皆さまに厚く御礼を申し上げます。 本当にどうもありがとうございました。

第５回DNA鑑定学会大会（東京・虎ノ門・発明会館）の２日目。朝から、ワークショップ「最新次世代シーケンサーの活用と解析」が開催されました。 以下のようなプログラムの下、活発な議論が繰り広げられました。若い人たちの出席が多く、将来の発展が大いに…

広島大学の山本卓（やまもと・たかし）教授のDNA鑑定学会の特別講演「人工ヌクレアーゼ(ZFNやTALEN)を用いたゲノム編集研究の現状と可能性」は、出席者に大きなインパクトを与えました。 今後も、DNA鑑定学会にご協力をいただけるということで、山本先生のご…

「人工ヌクレアーゼによって誘導されたDNA二本鎖の切断は、主に非相同末端連結によって修復されますが、そこ過程でしばしば塩基の欠失や挿入が起こり、標的遺伝子がは破戒されます。また、標的遺伝子の相同配列を両端にもつ(GFPなどの)外来遺伝子を共導入す…

最近によく使われだした人工ヌクレアーゼが、ターレンと言われるものです。 ターレンは、標的な配列が比較的に自由に選択できる植物の病原性細菌キサントモナスのTALE由来ののDNA結合ドメインを利用したもので、Transcription Activator-Like Effector Nucle…

人工ヌクレアーゼとは、ゲノム上の標的配列に特異的に結合するDNA結合ドメインと制限酵素FokIのDNA切断ドメインを融合したキメラタンパク質のことです。 いままでよく使われていた人工ヌクレアーゼは、Zinc fingerをDNA結合ドメインとして利用したZFN (zinc-…

設計可能な人工制限酵素(人工ヌクレアーゼ)を用いて、ゲノム上の特定の遺伝子をノックアウトしたり、標識遺伝子をノックインする技術を、｢ゲノム編集(Genome Editing)｣といいます。おそらく、全面的なゲノム工学(Genome Engineering)に向かうための基礎とな…

クリスマスカードの交換は、年が経つにつれて国際的なお付き合いの人達の人数も増えてきました。研究関係のお付き合いだけでも、今年は１４０枚を用意しています。単価が年賀状よりかなり高いので、ちょっと覚悟の個人的な出費となります。自筆のサインを入…

DNA鑑定学会大会は、参加費無料です。東京の虎ノ門の発明会館で行われます。 まだ予定の席がありますので、どうかご参加ください。お願いいたします。 事前登録していただければ、一部のご参加でもかまいません。重ねて、どうか奮ってのご参加をお願いいたし…

名古屋市立大学の鈴木善幸教授が、集団遺伝研究部門のEVO-GENセミナーに参加するとともに、Biological Symposiumで講演しました。 夜は、三島駅前で夕食会が開催されました。共同研究を積極的に展開する鈴木教授。応援しています！

明後日からいよいDNA鑑定学会が東京・虎ノ門の発明会館で始まります。 いま、「ゲノム編集」で注目浴びています広島大学の山本卓先生の特別講演 最新のDNA鑑定装置の説明や欧米における動きに詳しい東北大学の橋谷田先生の特別講演 ISO認定制度のメリット等…

「放射線医科学」の推進が重要であるという声を、最近よく聞きます。福島の原発事故との関連ももちろんありますが、がん治療などに様々なタイプの放射線が非常に活躍したり、分子イメージングもその分野に入るでしょう。 一方、大学における放射線科に入る医…

三島では、朝から冷たい雨が降っています。気温はそんなに低くはないのですが、雨が周りを冷たくしているようです。 北海道では、季節的には、この冷え込みが、いわゆる｢リラ冷え｣と言われているものに対応するのでしょうか。いえいえ、｢リラ冷え｣は、だいた…

藍藻（らんそう）はシアノバクテリア（藍色細菌）とも呼ばれる真正細菌の1群であり、光合成によって酸素を生み出すという特徴を持ちます。単細胞で浮遊するもの、少数細胞の集団を作るもの、糸状に細胞が並んだ構造を持つものなどがあるのですが、「藍藻」と…

藻類とは、地上植物を除く酸素発生型光合成を行う雑多な生物の総称であります。つまり、総称に過ぎないことの認識を持つことが大切なようです。 （引用：http://ja.wikipedia.org/wiki/%E8%97%BB%E9%A1%9E） ーー 「藻類（そうるい, algae）とは、酸素発生型…

面白い記事を目にしました。「造本有理」と題する多摩美術大学の平出隆教授の「本作り」の記事でした。わずか８ページからなる本、表紙が封筒でアマゾンに申し込めばそのまま郵便で送ってくると言う極薄の本の出版。 世の中には、本当に面白い「仕事」という…

珪藻（ケイソウ）は不等毛植物門珪藻綱に属する単細胞性の藻類で、細胞が珪酸質の被殻 (frustule) に入っているのが特徴です。 珪藻は全て光合成を行う独立栄養生物で、細胞内に1個から多数の葉緑体を持ち、褐藻等と同じくクロロフィルa、c1、c2の光合成色素…

独立行政法人・水産総合研究センター(Incorporated Administrative Agency, Fisheries Research Agency: FRA)の東北区水産研究所(東北水研)が所有する調査船「若鷹丸」に乗船して、海洋微生物メタゲノム解析の現場を見てきました。 残念ながら悪天候で航海は…

早朝の午前5:20頃に宮城県沖で地震があり、塩釜のビジネスホテルで寝ていたら、大きな揺れを感じて、びっくりして目覚めてしまいました。 帰りの新幹線で、塩釜から仙台経由で東京までたどり着き、東海道新幹線に乗った途端、品川駅の手前で「停電」。新幹線…

同日の朝日新聞2012年11月24日(土)の朝刊の別刷版「Be」の「フロントランナー」に、本年2012年9月24日(月)の教授が学会長の日本遺伝学会の九州大会（大会長:中別府雄作教授）の一般公開講演会で「生活習慣病のゲノム疫学」と題して講演いただいた、久山町研…