天文学分野の｢暗黒｣物質や｢暗黒｣どエネルギーの｢暗黒｣を拝借して、｢暗黒DNA｣というときは、ふたつの全く異なる意味で使われようとしているので、是非気を付けましょう。 ひとつは、ENCODEプロジェクトのいう意味での｢junkDNA｣などの機能の分かっていないゲノム領域を示します。
もうひとつは、メタゲノム解析などで、培養不能なバクテリアなどがゲノム上にもつ莫大な総数に上る機能未知の遺伝子の総体のことで、クレイグ・ベンダー博士は｢Dark Matters of Life (生命の暗黒物質)｣と呼んだりしています。
