啐啄同時

若手研究者を応援するオヤジ研究者の独白的な日記です。

2012-09-01から1日間の記事一覧

トリオシーケンシング

父母子の全ゲノム解析による各ゲノムの一意的決定は、ちょうど連立方程式で複数の解を同時に出すようなもので、親子3人の完全ゲノムの比較解析から、少なくとも子供の全ゲノムのハプロタイプ(haplotype)を一意的にかつ同時に決めるものです。 これは、2007年…

SNPだけが変異ではない

確かに、SNPのような塩基置換だけを変異の対象として捉えると、どのプラットフォームをシーケンサーとして用いるかにもよりますが、シーケンシングエラー率に非常に注意する必要があります。しかし、Indel(挿入や欠失)・転移/転座や逆位(transversion/trans…

福島県立医大で全ゲノム解析

昨日(2012年8月31日(金))に、細野環境大臣が、福島県立医大で新生児を中心に全ゲノム解析をおこなう計画を、9月7日までの概算要求に盛り込むことを発表したと、NHKや新聞各社が報道しました。 毎日新聞などは、現在のシーケンサーの精度では放射能の影響によ…