啐啄同時

若手研究者を応援するオヤジ研究者の独白的な日記です。

「京」とゲノム関連研究への応用

スパコン「京」におけるゲノム関連研究への応用が本格化して来ています。
 一方で、課題も見えてきました。「京」の一般利用が開始されて、運用上の制約も大きくなってきています。さらに、ゲノム関連研究では、もともと原始的な並列性がありますので、ひとつのジョブを高度な並列化を行って計算するよりも、たくさんのジョブを同時に行って効率的な計算を行いたいという意向があります。
 このあたりの計算に対する考え方の異なり方というのは、今後「京」のゲノム関連研究への応用に大きな影響を与える可能性があります。