啐啄同時

若手研究者を応援するオヤジ研究者の独白的な日記です。

メタゲノム解析の今後

 最近のNature誌のArticle論文では、Peer Bork博士達のグループが腸内細菌の動的な組成変化の研究成果を発表しています。
 興味深いのは、すでに発表されている3つ大きなデータセットを一緒にして情報解析をおこなう、いわゆる「メタ解析」をおこなったものです。
 ダジャレのようですが、「メタゲノム解析のメタ解析」が今後とも増加していくものと思います。
 また、「synonymous vs nonsynonymous substitutionn (同義置換vs非同義置換)」の解析を、メタゲノム的に応用しわずかに修正したpN/pSという量を用いています。
(参考:Nature 493, 45–50 (3 January 2013) | doi:10.1038/nature11711 "Genomic variation landscape of the human gut microbiome" by Siegfried Schloissnig , Manimozhiyan Arumugam , Shinichi Sunagawa , Makedonka Mitreva , Julien Tap , Ana Zhu , Alison Waller , Daniel R. Mende , Jens Roat Kultima , John Martin , Karthik Kota , Shamil R. Sunyaev , George M. Weinstock & Peer Bork;
http://www.nature.com/nature/journal/v493/n7430/abs/nature11711_ja.html