横浜駅と新横浜駅は、かなり離れています。大阪駅と新大阪駅との離れ方より、ずっと大きいです。
三島からの遠乗りだと、一般に東海道新幹線が一番便利ではありますが、総研大本部のあります葉山に行くには、逗子駅まで東海道線と逗子線で行くことになります。
三島から横浜まで行くとすると、まずは新横浜まで東海道新幹線で行き、そこから横浜線で菊名か東神奈川まで行って、みなとみらい線か京浜東北線などで横浜に行くのが一般的でしょう。
しかし、実際には、これも時間帯によって、東海道線の在来線を使う場合が便利で早い場合があるようです。
在来線の旅、本当は時間がある場合には、ぶらりとするのが一番なんでしょうが・・。